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시나리오	임상역학 연구3 - 자료	PDF
	임상역학 연구2 - 자료	PDF Data
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분류	분석명	사용프로그램	작업
시나리오	임상역학및유전체 연구6 - 자료	PLINK, plink2, GCTA	PDF
	임상역학및유전체 연구5 - 자료	PLINK, plink2, GCTA	PDF Data
	임상역학및유전체 연구4 - 자료	PLINK, plink2	PDF Data
	임상역학및유전체 연구3 - 자료	R, PLINK, plink2, BCFtools, Eagle, Minimac4	PDF Data
	임상역학및유전체 연구2 - 자료	PLINK, plink2	PDF Data
	임상역학및유전체 연구1 - 자료	PLINK, plink2, BCFtools, Eagle, Minimac4	PDF Data
ForGWAS	품질정제(Data quality control, QC)	PLINK	보기
	주성분 분석(PCA) 및 품질관리(QC)	R, plink2	보기
GWAS	로지스틱 회귀분석(Logistic regression)	PLINK	보기
	선형 회귀분석 (Linear regression)	PLINK	보기
	다항 로지스틱 회귀분석 (Multinomial logistic regression)	R	보기
	선형 혼합 모델(Linear Mixed Models, LMM)	BOLT-LMM, ONE-TOOL, R	보기
	희귀 변이(Rare variant) 분석 (Gene-based)	R	보기
PRS	다중 유전자 위험 점수 모형; PRS(polygenic risk score) model	LDpred, PLINK	보기
Other Analysis	유전변이 정보규명 (SNP Annotation)	SnpSift	보기
	유전율 (Heritability, h2) 분석	GCTA, LDAK, LDSC	보기
	연관불균형(Linkage disequilibrium, LD) 분석	PLINK	보기
Plotting	다차원 척도법(Multi-Dimensional Scaling, MDS) 플롯	R	보기
	QQ plot	R	보기
	맨하탄 (Manhattan) 플랏	R	보기